文章标签:SEQ ata CAL 调用
源代码名称:NucleoATAC 源代码网址:http://www.github.com/GreenleafLab/NucleoATAC NucleoATAC源代码文档 NucleoATAC源代码下载Git URL: Git Clone代码到本地: Subversion代码到本地:
文章标签:CAL 调用 SEQ ata
nucleosome calling using ATAC-seq
git://www.github.com/GreenleafLab/NucleoATAC.gitgit clone http://www.github.com/GreenleafLab/NucleoATAC$ svn co --depth empty http://www.github.com/GreenleafLab/NucleoATAC
Checked out revision 1.
$ cd repo
$ svn up trunk NucleoATAC
使用usn序列数据调用nucleosomes的python 包。 还包括用于处理对端usn数据( 或者潜在的其他配对的结束数据)的通用脚本。
如果你在研究中使用这里工具，请参考基因组研究的论文。
请使用GitHub问题来产生软件发生的任何错误，而不是发邮件给作者。
在版本上注意：
- 版本 0代表用于biorxiv手稿的代码
- 版本 0.2.1用于基因组研究手稿( 见补充资料)
可以在 http://nucleoatac.readthedocs.org/en/latest/ 找到文档。
如果你想在NucleoATAC输出中轻松读取到 R 以便进一步处理或者探索，请查看 NucleoATACR。
目前NucleoATAC只支持 python 2.7 ( 无 python 3 )。 如果有人对添加 python 3支持感兴趣，请点击requests请求"
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