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文章标签:SEQ  ata  CAL  调用  
nucleosome calling using ATAC-seq

  • 源代码名称:NucleoATAC
  • 源代码网址:http://www.github.com/GreenleafLab/NucleoATAC
  • NucleoATAC源代码文档
  • NucleoATAC源代码下载
  • Git URL:
    git://www.github.com/GreenleafLab/NucleoATAC.git
  • Git Clone代码到本地:
    git clone http://www.github.com/GreenleafLab/NucleoATAC
  • Subversion代码到本地:
    $ svn co --depth empty http://www.github.com/GreenleafLab/NucleoATAC
    Checked out revision 1.
    $ cd repo
    $ svn up trunk
  • NucleoATAC

    使用usn序列数据调用nucleosomes的python 包。 还包括用于处理对端usn数据( 或者潜在的其他配对的结束数据)的通用脚本。

    如果你在研究中使用这里工具,请参考基因组研究的论文。

    请使用GitHub问题来产生软件发生的任何错误,而不是发邮件给作者。

    在版本上注意:

    • 版本 0代表用于biorxiv手稿的代码
    • 版本 0.2.1用于基因组研究手稿( 见补充资料)

    可以在 http://nucleoatac.readthedocs.org/en/latest/ 找到文档。

    如果你想在NucleoATAC输出中轻松读取到 R 以便进一步处理或者探索,请查看 NucleoATACR

    目前NucleoATAC只支持 python 2.7 ( 无 python 3 ) 。 如果有人对添加 python 3支持感兴趣,请点击requests请求"



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