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文章标签:数据  
Program for analysing NGS data.

  • 源代码名称:angsd
  • 源代码网址:http://www.github.com/ANGSD/angsd
  • angsd源代码文档
  • angsd源代码下载
  • Git URL:
    git://www.github.com/ANGSD/angsd.git
  • Git Clone代码到本地:
    git clone http://www.github.com/ANGSD/angsd
  • Subversion代码到本地:
    $ svn co --depth empty http://www.github.com/ANGSD/angsd
    Checked out revision 1.
    $ cd repo
    $ svn up trunk
  • Build Status angsd:

    NGS数据分析程序。

    http://www.popgen.dk/angsd

    插件安装:
    • 使用包含htslib的本地文件夹

    git clone https://github.com/samtools/htslib.git

    git clone https://github.com/angsd/angsd.git

    cd htslib ;制作;光盘。/angsd ;制作 HTSSRC= 。/htslib

    • htslib的全系统安装

    git clone https://github.com/angsd/angsd.git

    cd angsd ;制作

    注释
    • 我已经切换到使用htslib解析单个读取( 允许阅读,同时避免编写自己的填充解析器) 。 我还在用我自己的readpools 。 因此,用户也应该下载并安装 htslib 。
    程序有一张纸

    http://www.biomedcentral.com/1471-2105/15/356/abstract



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